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上海的三甲医院有很多。花了半天时间找的，可能还有遗漏，见谅。
先说黄浦区，黄浦区有六家三甲医院，分别是：上海长征医院、复旦大学附属妇产科医院、上海交通大学医学院附属仁济医院、上海交通大学医学院附属第九人民医院、上海交通大学附属瑞金医院、上海中医药大学附属光医院。
上海长征医院，全称第二军医大学长征医院，是一所集医疗、教学、科研为一体的综合性三级甲等医院。医院前身是1900年德国宝隆博士创办的“宝隆医院”，1930年更名为“国立同济大学附属医院”，1948年更名为“中美医院”；1955年10月，由时任国防部长彭德怀元帅签署命令，成立了“上海急症外科医院”；1958年9月，列编为“第二军医大学第二附属医院”；1966年9月，经上海市批准对外称“上海长征医院”。
复旦大学附属妇产科医院，也就是大家所熟悉的红房子医院，由中国首家妇产专科医院——西门妇孺医院发展而来，是美国人Margaret Williamson于1884年捐资创办。因创建时英文名为Margaret Williamson Red House Hospital且屋顶呈红色，被广大市民以及患者亲切地称为“红房子医院”，多次被评为上海市文明单位。
上海交通大学医学院附属仁济医院，仁济医院是上海开埠后的第一家西医院，始建于1844年，是一所集医疗、教学、科研于一体的三级综合医院。
威廉•洛克哈脱医师在英国基督教伦敦会主管麦特赫斯脱牧师(W•H•Medhorst)的协助下创办了仁济医院的前身“中国医院”(CHINESE HOSPITAL)，亦称“华人医院”，并于1844年2月正式开业。这是外国教会在上海建立的最早一家西式医院。
上海交通大学医学院附属第九人民医院，前身“伯特利医院”创建于1921年。1952年更名为上海第九人民医院，1964年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院，是一家三级甲等医院。
上海交通大学附属瑞金医院，瑞金医院建于1907年，原名广慈医院，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，有着百年的深厚底蕴。20世纪50年代，瑞金医院因成功救治严重烧伤面积达89.3%钢铁工人邱财康，打破了当时国际上“烧伤总面积超过80％无法治愈”的定论而蜚声国内外，指导大面积烧伤补液的“瑞金公式”作为经典规范沿用在全球范围内沿用至今；1957年确诊国内首例原发性醛固酮增多症，奠定了中国内分泌代谢病学的基础；70年代完成了国内首例同种异体心脏移植和首例同种异体肝脏移植；90年代在白血病分子生物学研究和临床医疗领域取得了重大进展，急性早幼粒白血病治疗的“上海方案”已成为国际公认的规范治疗手段。
上海中医药大学附属光医院，曙光医院的前身始建于1906年，原宁波府属的奉化、慈溪等地在沪商人创设的同乡会性质的“四明公所”在上海八仙桥宁寿里几间旧房子开设的一家小型医院，是至今能追溯到的医院最初原型。1922年9月迁至当时法租界爱来格路建造新屋，并正式取名四明医院。1953年更名为上海市第十人民医院。1954年8月在其南侧兴建当时上海唯一的中医医院—上海市第十一人民医院。1960年两院合并为上海中医学院附属医院——曙光医院，成为上海市十大综合性医院之一。
接下来是徐汇区的三甲医院，徐汇区的三甲医院数量很多，分别是：复旦大学附属华山医院、复旦大学附属眼耳鼻喉科医院、复旦大学附属中山医院、复旦大学附属肿瘤医院、上海中医药大学附属龙华医院、中国福利会国际和平妇幼保健院、上海交通大学附属第六人民医院、上海交通大学附属胸科医院、上海市徐汇区精神卫生中心。
华山医院始建于1907年，是国家卫生计生委委属医院、复旦大学附属教学医院和中国红十字会冠名的医院，1992年首批通过国家三级甲等医院评审，为全国文明单位，是国内最著名、最具国际化特征的医教研中心之一，也是全国首家通过JCI认证的部属公立医院，在国内外享有很高声誉。
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院，这个名字可能大家会比较陌生，但说起上海市五官科医院，基本上无人不知，无人不晓。复旦大学附属眼耳鼻喉科医院由国家一级教授胡懋廉、郭秉宽等创办于1952年，创办时名为上海医学院眼耳鼻喉科医院，2000年复旦大学与上海医科大学合并后更为现名。是国家卫生计生委所属唯一一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等眼耳鼻喉专科医院。2006年获得第二冠名——上海市五官科医院，亦为上海市红十字冠名医院、国家临床药物实验机构。
PS：有很多打着五官科医院的莆田系，但五官科医院只有一家，复旦大学附属眼耳鼻喉科医院，地址：上海汾阳路83号。
复旦大学附属中山医院，中山医院创建于1936年，隶属于国立上海医学院，为纪念中国民主革命的先驱孙中山先生而命名为孙中山纪念医院，后更名为中山医院。
复旦大学附属肿瘤医院位于上海市东安路270号，始建于1931年3月1日，医院前身是“中比镭锭治疗院”，是一所集医疗、教学、科研、预防为一体的三级肿瘤医院。
上海中医药大学附属龙华医院，上海中医药大学附属龙华医院又名上海龙华医院，创建于1960年7月，是全国最早建立的四大中医临床基地之一。
中国福利会国际和平妇幼保健院，中国福利会国际和平妇幼保健院是前国家名誉主席宋庆龄为保护妇女和儿童的健康，于1952年以她荣获的“国际和平奖金”创办的一所妇幼保健专科医院，前身是上海胶州路妇幼保健站和沪西女工保健站。
上海交通大学附属第六人民医院，上海市第六人民医院、上海交通大学附属第六人民医院建于1904年，是一所大型综合性教学三级甲等医院。设有33个临床科室、9个医技科室。
上海交通大学附属胸科医院，上海胸科医院（上海交通大学附属胸科医院）创建于1957年，是一家以诊治心、肺、食管、气管、纵隔疾病为主的三级甲等专科医院。
上海市徐汇区精神卫生中心，上海市精神卫生中心又名上海市心理咨询中心，原名上海市精神病防治院，前身为普慈疗养院，始建于1935年。2006年5月上海市精神卫生中心正式成为上海交通大学医学院的附属医院。上海市精神卫生中心是上海市三级甲等精神卫生专科医院，担负着全市精神卫生的医疗、教学、科研、预防、康复、心理咨询和对外学术交流等任务。上海市疾病预防控制精神卫生分中心、上海市精神卫生临床质量控制中心、上海市心理咨询培训中心、上海市自愿戒毒中心、国家精神药物临床试验机构、WHO/上海精神卫生研究与培训合作中心挂靠于本中心。
长宁区的三甲医院军队医院比较多，中国人民解放军第四五五医院、上海市皮肤病性病医院、中国人民解放军第八五医院、上海市长宁区光华中西医结合医院、上海武警医院、上海华山东方乳房专科医院。
中国人民解放军第455医院是一所具有70多年历史，集医疗、教学、科研为一体的大型综合性三等甲A驻军医院。
上海市皮肤病性病医院，上海市皮肤病医院建于1945年，是一所以皮肤病、性病为主要诊疗特色的公立三级专科医院，是上海市住院医师规范化培养基地和专科医师规范化培训基地。
中国人民解放军第八五医院，中国人民解放军第八五医院—上海滩知名的老牌部队医院始建于1949年，坐落于上海市华山路1328号，是南京军区驻沪的中心医院。
上海市光华中西医结合医院，位于上海市长宁区新华路，成立于1958年，属于三级甲等专科医院。
上海武警医院，上海武警医院创立于1948年，是一所三级甲等”医院。
上海华山东方乳房专科医院，成立于2001年6月，隶属于华山医院。前身为复旦大学(原上海医科大学)附属华山医院普外科乳房甲状腺组和上海房地产局职工医院(上海东方乳腺疾病医院)。两院合并后对外更名为此专科医院。
静安区三甲医院：上海市第一妇婴保健院、上海华东医院、上海市眼病防治中心医院、上海市儿童医院、上海市中医医院、上海第十人民医院。
上海是第一妇婴保健院，创建于1947年2月，是我国最早成立的省市级妇幼保健院之一。1952年9月，更名为上海市第一妇婴保健院。
复旦大学附属华东医院成立于1951年，现已发展成为一所以老年医学为特色，集医疗、教学、科研、预防为一体，立足上海、面向国内外的三级甲等综合性医院。
上海市眼病防治中心前身为解放前的盖氏沙眼防治所。1951年初更名为上海市沙眼中心防治所，隶属于市卫生局。1984年冠名为上海市眼病中心防治所，地址在上海市常德路225号。1995年初至1998年年中曾加挂上海市眼科医院(筹)。1998年12月更名为上海市眼病防治中心，迁址至上海市康定路380号。
上海市儿童医院是一所集医疗、保健、教学、科研、康复于一体的三级甲等儿童医院，前身是1937年创办的上海难童医院。
上海市中医医院，上海市中医医院创建于1954年，2005年成为上海中医药大学附属医院。是一所中医特色浓厚、临床科室齐全、医学人才汇聚，集医、教、研为一体的三级甲等综合医院。
上海第十人民医院，位于上海市延长中路301号，始建于1910年，是一所三级综合性医院，是上海市医保定点单位。
普陀区有一家三甲医院：同济大学附属同济医院。
上海市同济医院（同济大学附属同济医院）位于上海市新村路389号，占地62亩，建筑面积近10万平方米，是一所集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等综合性医院，是上海市医保定点单位,是国家临床药物试验机构、卫生部专科医师培训基地、上海市住院医师规范化培养和全科医师培养临床基地。
虹口区三甲医院：上海第一人民医院、岳阳医院，解放军411医院
上海市第一人民医院，上海交通大学附属第一人民医院，创建于1864年，原名公济医院，1992年首批通过三级甲等医院评审，是集医、教、研、防为一体的综合性医院。
上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院主院区位于上海市虹口区甘河路110号，创建于1976年，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级中西医结合综合性医院。
解放军411医院，成立于1949年5月，地处上海市虹口区繁华的四川北路，毗邻鲁迅公园和多伦路文化名人街。
杨浦区三甲医院：上海交通大学医学院附属新华医院、第二军医大附属长海医院、第二军医大附属东方肝胆外科医院、同济大学附属肺科医院。
新华医院，上海交通大学医学院附属医院，创建于1958年，是新中国成立以来上海自行设计建设的首家综合性医院。医院占地面积109亩，总体建筑面积19.2万平方米，先后获全国先进集体、全国卫生系统先进单位、全国卫生系统卫生文化建设先进单位和上海市文明单位等荣誉称号。
国家级重点专科：检验科、药学部、儿内科、耳鼻咽喉-头颈外科、心脏大血管外科、普外科、皮肤科、中医儿科、急诊医学科、小儿外科。上海市级重点学科：儿童保健学科、临床营养科、新生儿外科。
上海长海医院创建于1949年7月，始称华东军区人民医学院附属医院，1951年7月改称第二军医大学附属医院，1958年9月建制为第二军医大学第一附属医院。
中国人民解放军第二军医大学第三附属医院（东方肝胆外科医院，东方肝胆外科研究所），由我国肝胆外科主要奠基人和开拓者、著名肝脏外科专家、中国科学院院士吴孟超教授创建并领导，是在1956年肝脏外科三人攻关小组、1978年全国第一个肝胆外科和1996年全国第一个肝胆外科专科医院基础上发展起来的以肝胆外科为特色的三级甲等综合医院。建筑面积20万平方米，展开床位1500张，是国内一次建成体量最大的医院。现为国家重点学科，国家级继续医学教育基地，全军肝胆外科专科中心，全军肝胆外科研究所，国家教育部和全军重点实验室，军队“重中之重”建设学科，上海市医学领先专业重点学科，上海市重中之重临床医学中心。
同济大学附属肺科医院（上海市职业病医院）、同济大学附属上海市肺科医院创建于1933年，1998年上海市职业病医院整合到医院，2005年又成为同济大学附属医院，现直属上海市卫生局领导，是以呼吸系统疾病诊治为特色的三级甲等专科医院。
闵行区三甲医院：复旦大学附属儿科医院、复旦大学附属华东医院闵行门诊部
复旦大学附属儿科医院，复旦大学附属儿科医院创建于1952年，系卫生部部属“三级甲等”医院，是集医教研为一体的综合性儿童专科医院。全国儿科学重点学科、国家“211工程”重点建设单位。最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学（儿科学组）博士后流动站的单位。多次被评为上海市文明单位。医院定位：立足上海、服务全国、辐射亚洲。目标成为中国及亚洲儿童医学中心之一；成为儿科医学教育向全国辐射的中心；成为国际儿科学术交流的主要桥梁。
复旦大学附属华东医院闵行门诊部，华东医院闵行分院位于闵行梅陇地区 与莘庄相邻 建筑面积 余平方米 就医环境舒适 宽敞 就医流程便捷 合理 门诊部依托院总部医疗优势和先进的诊疗设备 将三级甲等医院的医疗水平服务于广大市民 门诊部应诊科室齐全 开展了集普通门诊 特色专科 专病门诊 专家门诊和社区健康生活指导及各层次的健康体检为一体的医疗服务
浦东新区三甲医院：上海仁济医院东院、上海东方医院、上海儿童医学中心、上海市第七人民医院、曙光医院张江分院
上海仁济医院东院，位于上海市东方路1630号，是上海仁济医院的浦东分院，规模在西院之上。
上海东方医院，全名同济大学附属东方医院，始建于1920年，是一所三级甲等综合性医院。医院南北两址，分别位于上海陆家嘴金融贸易区和世博园区，总建筑面积16万平方米。
上海儿童医学中心，上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心，是由上海市人民政府与世界健康基金会（Project HOPE）合作共建的一所集医、教、研于一体的三级甲等儿童专科医院。1998年6月1日医院正式开张，前国家主席江泽民同志为医院题写院名，美国前总统夫人希拉里 · 克林顿女士为医院开张剪彩，2011年，美国新任驻华大使骆家辉先生到访医院，将儿中心誉为“中美医学成功合作典范”。
上海市第七人民医院，位于上海市浦东新区高桥镇大同路358号，占地面积80000余平方米，始建于1931年，是一所是集医疗、科研、教学为一体的三级中西医结合医院，是上海市医保定点单位。
上海中医药大学附属曙光医院张江分院，位于浦东张江高科技园区张衡路528号，投资6亿元，占地160亩，是融现代建筑与传统特色为一体的园林式医院。
金山区三甲医院：上海市公共卫生中心。
复旦大学附属公共卫生临床中心，始建于1914年，位于上海市金山区。是上海市卫生局直属的市级专科医院和上海市疾病控制中心的临床基地，也是上海铁道大学医学院的教学医院和卫生部全国传染病医师培训基地，1995年被评为三级甲等医院，连续15年被评为局、市、部文明单位。
宝山区三甲医院：上海第三人民医院。
上海交通大学医学院附属第三人民医院，创建于1980年，是一所三级综合性医院。
松江区三甲医院：上海解放军部队医院
上海解放军部队医院位于上海市松江，创建于1951年，是集医疗、保健、教学、科研于一体的大型现代化综合性部队医院，花园式院区布局，倾力保障部队官兵及百姓健康，给广大伤病员提供优美宜人的安静休养环境。医院担负党中央、中央军委和总部首长及部分驻沪部队官兵的医疗保健任务，承担各军区、军兵种转送的疑难、危重病人的诊治工作，收治全国各地的患者。
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